У офіційних матчах за «Буковину» Маковійчук дебютував 30 липня 2001 року. Того дня наша команда переграла у рідних стінах колектив «Сокіл» (Золочів) – 2:1. Один із голів у ворота суперника забив Степан Маковійчук. На сьогоднішній день вихованець буковинського футболу зіграв за рідну команду 183 офіційних матчів (33 голи).

Степан Маковійчук також захищав кольори команд «Ністру» (Атаки, Молдова), «Газовик – Скала» (Стрий) та «Нива» (Вінниця).